Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU4

Fam83f, Protein FAM83F, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83fQ3UKU4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam83fQ3UKU4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam83fQ3UKU4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam83fQ3UKU4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam83fQ3UKU4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam83fQ3UKU4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam83fQ3UKU4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam83fQ3UKU4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam83fQ3UKU4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fam83fQ3UKU4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fam83fQ3UKU4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fam83fQ3UKU4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fam83fQ3UKU4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms