Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms