Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NrepQ07475 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NrepQ07475 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NrepQ07475 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NrepQ07475 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NrepQ07475 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
NrepQ07475 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms