Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPINDOCQ05AH6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPINDOCQ05AH6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPINDOCQ05AH6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPINDOCQ05AH6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPINDOCQ05AH6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SPINDOCQ05AH6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SPINDOCQ05AH6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SPINDOCQ05AH6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPINDOCQ05AH6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPINDOCQ05AH6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPINDOCQ05AH6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPINDOCQ05AH6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPINDOCQ05AH6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPINDOCQ05AH6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPINDOCQ05AH6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPINDOCQ05AH6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPINDOCQ05AH6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPINDOCQ05AH6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPINDOCQ05AH6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPINDOCQ05AH6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPINDOCQ05AH6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPINDOCQ05AH6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPINDOCQ05AH6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SPINDOCQ05AH6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SPINDOCQ05AH6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPINDOCQ05AH6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPINDOCQ05AH6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPINDOCQ05AH6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPINDOCQ05AH6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPINDOCQ05AH6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPINDOCQ05AH6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPINDOCQ05AH6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPINDOCQ05AH6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPINDOCQ05AH6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPINDOCQ05AH6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPINDOCQ05AH6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPINDOCQ05AH6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPINDOCQ05AH6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPINDOCQ05AH6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPINDOCQ05AH6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPINDOCQ05AH6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPINDOCQ05AH6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPINDOCQ05AH6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPINDOCQ05AH6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPINDOCQ05AH6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPINDOCQ05AH6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms