Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms