Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VcpQ01853 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VcpQ01853 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VcpQ01853 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VcpQ01853 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VcpQ01853 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms