Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms