Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gjb2Q00977 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms