Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AlkP97793 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AlkP97793 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AlkP97793 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AlkP97793 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AlkP97793 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AlkP97793 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AlkP97793 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AlkP97793 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AlkP97793 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AlkP97793 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AlkP97793 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
AlkP97793 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
AlkP97793 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AlkP97793 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AlkP97793 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AlkP97793 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AlkP97793 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AlkP97793 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AlkP97793 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AlkP97793 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AlkP97793 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AlkP97793 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
AlkP97793 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AlkP97793 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
AlkP97793 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AlkP97793 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AlkP97793 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
AlkP97793 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AlkP97793 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AlkP97793 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AlkP97793 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AlkP97793 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AlkP97793 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AlkP97793 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AlkP97793 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AlkP97793 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AlkP97793 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AlkP97793 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AlkP97793 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AlkP97793 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AlkP97793 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AlkP97793 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AlkP97793 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AlkP97793 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
AlkP97793 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AlkP97793 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AlkP97793 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AlkP97793 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
AlkP97793 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AlkP97793 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AlkP97793 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AlkP97793 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AlkP97793 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AlkP97793 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AlkP97793 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AlkP97793 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AlkP97793 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AlkP97793 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AlkP97793 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AlkP97793 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AlkP97793 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AlkP97793 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AlkP97793 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AlkP97793 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AlkP97793 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AlkP97793 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AlkP97793 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
AlkP97793 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AlkP97793 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
AlkP97793 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AlkP97793 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AlkP97793 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AlkP97793 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AlkP97793 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AlkP97793 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AlkP97793 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
AlkP97793 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AlkP97793 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AlkP97793 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
AlkP97793 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AlkP97793 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AlkP97793 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AlkP97793 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AlkP97793 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AlkP97793 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AlkP97793 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
AlkP97793 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AlkP97793 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AlkP97793 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AlkP97793 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AlkP97793 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AlkP97793 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AlkP97793 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AlkP97793 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AlkP97793 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AlkP97793 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AlkP97793 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AlkP97793 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AlkP97793 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms