Protein–RNA interactions for Protein: P97368

Meis3, Homeobox protein Meis3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis3P97368 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Meis3P97368 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Meis3P97368 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Meis3P97368 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Meis3P97368 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Meis3P97368 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Meis3P97368 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Meis3P97368 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Meis3P97368 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Meis3P97368 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Meis3P97368 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Meis3P97368 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Meis3P97368 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Meis3P97368 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Meis3P97368 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Meis3P97368 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Meis3P97368 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Meis3P97368 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Meis3P97368 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Meis3P97368 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Meis3P97368 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Meis3P97368 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Meis3P97368 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Meis3P97368 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Meis3P97368 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Meis3P97368 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Meis3P97368 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Meis3P97368 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Meis3P97368 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Meis3P97368 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Meis3P97368 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Meis3P97368 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Meis3P97368 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Meis3P97368 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Meis3P97368 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Meis3P97368 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Meis3P97368 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Meis3P97368 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Meis3P97368 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Meis3P97368 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Meis3P97368 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Meis3P97368 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Meis3P97368 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Meis3P97368 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms