Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms