Protein–RNA interactions for Protein: P97304

Polr1d, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1dP97304 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1dP97304 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1dP97304 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1dP97304 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1dP97304 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1dP97304 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1dP97304 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1dP97304 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1dP97304 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1dP97304 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Polr1dP97304 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1dP97304 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Polr1dP97304 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1dP97304 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1dP97304 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1dP97304 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1dP97304 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1dP97304 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1dP97304 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1dP97304 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1dP97304 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1dP97304 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1dP97304 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1dP97304 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1dP97304 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Polr1dP97304 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Polr1dP97304 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Polr1dP97304 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Polr1dP97304 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Polr1dP97304 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Polr1dP97304 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Polr1dP97304 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Polr1dP97304 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1dP97304 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1dP97304 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1dP97304 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1dP97304 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1dP97304 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Polr1dP97304 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1dP97304 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1dP97304 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1dP97304 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1dP97304 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1dP97304 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1dP97304 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1dP97304 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1dP97304 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1dP97304 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1dP97304 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1dP97304 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1dP97304 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1dP97304 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1dP97304 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1dP97304 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1dP97304 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1dP97304 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1dP97304 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1dP97304 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1dP97304 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1dP97304 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1dP97304 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1dP97304 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1dP97304 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1dP97304 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1dP97304 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1dP97304 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1dP97304 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1dP97304 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1dP97304 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1dP97304 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1dP97304 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1dP97304 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1dP97304 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1dP97304 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1dP97304 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1dP97304 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1dP97304 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1dP97304 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1dP97304 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1dP97304 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1dP97304 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1dP97304 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1dP97304 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1dP97304 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1dP97304 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1dP97304 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1dP97304 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1dP97304 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1dP97304 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1dP97304 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1dP97304 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1dP97304 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Polr1dP97304 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1dP97304 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1dP97304 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1dP97304 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1dP97304 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1dP97304 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1dP97304 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1dP97304 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms