Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arf1P84078 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arf1P84078 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf1P84078 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arf1P84078 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arf1P84078 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms