Protein–RNA interactions for Protein: P83503

Nyx, Nyctalopin, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NyxP83503 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NyxP83503 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NyxP83503 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NyxP83503 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NyxP83503 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NyxP83503 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NyxP83503 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NyxP83503 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NyxP83503 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NyxP83503 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NyxP83503 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NyxP83503 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NyxP83503 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NyxP83503 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NyxP83503 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NyxP83503 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NyxP83503 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NyxP83503 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NyxP83503 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NyxP83503 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NyxP83503 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NyxP83503 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NyxP83503 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NyxP83503 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NyxP83503 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NyxP83503 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NyxP83503 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NyxP83503 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NyxP83503 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NyxP83503 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NyxP83503 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NyxP83503 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NyxP83503 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NyxP83503 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NyxP83503 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NyxP83503 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NyxP83503 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NyxP83503 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NyxP83503 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NyxP83503 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NyxP83503 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NyxP83503 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NyxP83503 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NyxP83503 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NyxP83503 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NyxP83503 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NyxP83503 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NyxP83503 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NyxP83503 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NyxP83503 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NyxP83503 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NyxP83503 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NyxP83503 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NyxP83503 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NyxP83503 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NyxP83503 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NyxP83503 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NyxP83503 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NyxP83503 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NyxP83503 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NyxP83503 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NyxP83503 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NyxP83503 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NyxP83503 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NyxP83503 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NyxP83503 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NyxP83503 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NyxP83503 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NyxP83503 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NyxP83503 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NyxP83503 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
NyxP83503 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NyxP83503 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NyxP83503 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NyxP83503 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NyxP83503 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NyxP83503 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NyxP83503 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NyxP83503 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NyxP83503 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NyxP83503 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NyxP83503 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NyxP83503 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NyxP83503 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NyxP83503 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NyxP83503 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NyxP83503 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NyxP83503 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NyxP83503 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NyxP83503 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NyxP83503 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NyxP83503 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NyxP83503 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NyxP83503 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NyxP83503 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NyxP83503 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NyxP83503 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NyxP83503 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NyxP83503 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NyxP83503 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms