Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gbx1P82976 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbx1P82976 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbx1P82976 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbx1P82976 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbx1P82976 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbx1P82976 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbx1P82976 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbx1P82976 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbx1P82976 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbx1P82976 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbx1P82976 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbx1P82976 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbx1P82976 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbx1P82976 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbx1P82976 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbx1P82976 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbx1P82976 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbx1P82976 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbx1P82976 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbx1P82976 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbx1P82976 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbx1P82976 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbx1P82976 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbx1P82976 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbx1P82976 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbx1P82976 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms