Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtnP63089 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtnP63089 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtnP63089 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtnP63089 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtnP63089 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtnP63089 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtnP63089 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtnP63089 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtnP63089 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtnP63089 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtnP63089 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtnP63089 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtnP63089 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtnP63089 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtnP63089 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtnP63089 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtnP63089 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtnP63089 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtnP63089 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtnP63089 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PtnP63089 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PtnP63089 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PtnP63089 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PtnP63089 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PtnP63089 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PtnP63089 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PtnP63089 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PtnP63089 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtnP63089 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtnP63089 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtnP63089 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtnP63089 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtnP63089 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtnP63089 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtnP63089 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtnP63089 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtnP63089 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtnP63089 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtnP63089 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtnP63089 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtnP63089 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtnP63089 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtnP63089 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtnP63089 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtnP63089 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtnP63089 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtnP63089 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtnP63089 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtnP63089 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtnP63089 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtnP63089 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtnP63089 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtnP63089 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtnP63089 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtnP63089 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtnP63089 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtnP63089 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtnP63089 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtnP63089 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtnP63089 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtnP63089 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtnP63089 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtnP63089 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtnP63089 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtnP63089 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtnP63089 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtnP63089 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtnP63089 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtnP63089 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtnP63089 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtnP63089 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PtnP63089 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtnP63089 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtnP63089 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtnP63089 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtnP63089 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtnP63089 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtnP63089 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtnP63089 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtnP63089 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtnP63089 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtnP63089 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PtnP63089 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtnP63089 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtnP63089 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PtnP63089 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtnP63089 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtnP63089 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtnP63089 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtnP63089 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtnP63089 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtnP63089 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtnP63089 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtnP63089 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtnP63089 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtnP63089 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtnP63089 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtnP63089 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtnP63089 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms