Protein–RNA interactions for Protein: P61222

Abce1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abce1P61222 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abce1P61222 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abce1P61222 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abce1P61222 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Abce1P61222 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Abce1P61222 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Abce1P61222 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Abce1P61222 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Abce1P61222 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Abce1P61222 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Abce1P61222 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Abce1P61222 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abce1P61222 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abce1P61222 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abce1P61222 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abce1P61222 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abce1P61222 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abce1P61222 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abce1P61222 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Abce1P61222 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abce1P61222 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abce1P61222 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abce1P61222 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abce1P61222 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abce1P61222 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abce1P61222 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Abce1P61222 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abce1P61222 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abce1P61222 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Abce1P61222 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abce1P61222 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Abce1P61222 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Abce1P61222 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Abce1P61222 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abce1P61222 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abce1P61222 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Abce1P61222 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Abce1P61222 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abce1P61222 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abce1P61222 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Abce1P61222 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abce1P61222 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Abce1P61222 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abce1P61222 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Abce1P61222 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abce1P61222 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abce1P61222 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abce1P61222 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abce1P61222 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abce1P61222 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abce1P61222 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abce1P61222 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms