Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
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Cldn18P56857 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn18P56857 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Cldn18P56857 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Cldn18P56857 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Cldn18P56857 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Cldn18P56857 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn18P56857 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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