Protein–RNA interactions for Protein: P55258

Rab8a, Ras-related protein Rab-8A, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab8aP55258 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab8aP55258 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab8aP55258 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms