Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab11bP46638 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab11bP46638 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab11bP46638 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab11bP46638 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab11bP46638 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab11bP46638 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab11bP46638 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab11bP46638 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab11bP46638 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab11bP46638 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab11bP46638 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab11bP46638 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab11bP46638 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab11bP46638 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rab11bP46638 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rab11bP46638 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rab11bP46638 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab11bP46638 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab11bP46638 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab11bP46638 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab11bP46638 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab11bP46638 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab11bP46638 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab11bP46638 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab11bP46638 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab11bP46638 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab11bP46638 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab11bP46638 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab11bP46638 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab11bP46638 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rab11bP46638 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab11bP46638 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab11bP46638 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab11bP46638 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab11bP46638 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab11bP46638 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab11bP46638 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab11bP46638 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab11bP46638 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab11bP46638 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab11bP46638 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab11bP46638 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab11bP46638 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab11bP46638 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab11bP46638 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab11bP46638 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab11bP46638 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab11bP46638 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rab11bP46638 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab11bP46638 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab11bP46638 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab11bP46638 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab11bP46638 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab11bP46638 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab11bP46638 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab11bP46638 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab11bP46638 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab11bP46638 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab11bP46638 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab11bP46638 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab11bP46638 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab11bP46638 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab11bP46638 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab11bP46638 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rab11bP46638 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab11bP46638 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab11bP46638 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab11bP46638 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab11bP46638 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab11bP46638 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab11bP46638 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab11bP46638 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab11bP46638 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab11bP46638 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab11bP46638 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rab11bP46638 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab11bP46638 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab11bP46638 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab11bP46638 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rab11bP46638 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rab11bP46638 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rab11bP46638 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Rab11bP46638 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms