Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms