Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tfap2aP34056 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfap2aP34056 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.1 ms