Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoc3P33622 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms