Protein–RNA interactions for Protein: P31316

Gsx2, GS homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsx2P31316 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gsx2P31316 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gsx2P31316 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gsx2P31316 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gsx2P31316 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gsx2P31316 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gsx2P31316 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gsx2P31316 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gsx2P31316 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gsx2P31316 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gsx2P31316 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gsx2P31316 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gsx2P31316 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gsx2P31316 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gsx2P31316 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gsx2P31316 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gsx2P31316 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gsx2P31316 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gsx2P31316 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gsx2P31316 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gsx2P31316 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gsx2P31316 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gsx2P31316 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gsx2P31316 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gsx2P31316 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gsx2P31316 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gsx2P31316 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gsx2P31316 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gsx2P31316 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gsx2P31316 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gsx2P31316 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gsx2P31316 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gsx2P31316 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gsx2P31316 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gsx2P31316 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gsx2P31316 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gsx2P31316 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gsx2P31316 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gsx2P31316 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gsx2P31316 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gsx2P31316 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gsx2P31316 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gsx2P31316 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gsx2P31316 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gsx2P31316 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gsx2P31316 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gsx2P31316 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gsx2P31316 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gsx2P31316 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gsx2P31316 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gsx2P31316 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gsx2P31316 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gsx2P31316 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gsx2P31316 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gsx2P31316 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gsx2P31316 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gsx2P31316 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gsx2P31316 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gsx2P31316 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gsx2P31316 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gsx2P31316 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gsx2P31316 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Gsx2P31316 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gsx2P31316 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gsx2P31316 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gsx2P31316 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gsx2P31316 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gsx2P31316 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gsx2P31316 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gsx2P31316 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gsx2P31316 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms