Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa5P28312 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa5P28312 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa5P28312 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa5P28312 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa5P28312 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa5P28312 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa5P28312 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa5P28312 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa5P28312 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Defa5P28312 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa5P28312 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa5P28312 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa5P28312 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa5P28312 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa5P28312 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa5P28312 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa5P28312 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa5P28312 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa5P28312 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa5P28312 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa5P28312 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa5P28312 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa5P28312 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa5P28312 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa5P28312 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa5P28312 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa5P28312 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa5P28312 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa5P28312 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa5P28312 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms