Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms