Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Xrcc5P27641 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
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