Protein–RNA interactions for Protein: P21460

Cst3, Cystatin-C, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cst3P21460 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cst3P21460 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cst3P21460 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cst3P21460 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cst3P21460 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cst3P21460 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cst3P21460 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cst3P21460 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms