Protein–RNA interactions for Protein: P20352

F3, Tissue factor, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F3P20352 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
F3P20352 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
F3P20352 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
F3P20352 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
F3P20352 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
F3P20352 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
F3P20352 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
F3P20352 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
F3P20352 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
F3P20352 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
F3P20352 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
F3P20352 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F3P20352 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F3P20352 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F3P20352 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F3P20352 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F3P20352 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F3P20352 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
F3P20352 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F3P20352 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F3P20352 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
F3P20352 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
F3P20352 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F3P20352 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F3P20352 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F3P20352 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F3P20352 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
F3P20352 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F3P20352 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F3P20352 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F3P20352 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F3P20352 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
F3P20352 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F3P20352 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F3P20352 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F3P20352 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F3P20352 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
F3P20352 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
F3P20352 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
F3P20352 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
F3P20352 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
F3P20352 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
F3P20352 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
F3P20352 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
F3P20352 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
F3P20352 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
F3P20352 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
F3P20352 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
F3P20352 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
F3P20352 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
F3P20352 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
F3P20352 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
F3P20352 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
F3P20352 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
F3P20352 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
F3P20352 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
F3P20352 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
F3P20352 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
F3P20352 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
F3P20352 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
F3P20352 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
F3P20352 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
F3P20352 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
F3P20352 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
F3P20352 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
F3P20352 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
F3P20352 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
F3P20352 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
F3P20352 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
F3P20352 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
F3P20352 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
F3P20352 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
F3P20352 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
F3P20352 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
F3P20352 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
F3P20352 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
F3P20352 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
F3P20352 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
F3P20352 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
F3P20352 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
F3P20352 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
F3P20352 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
F3P20352 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
F3P20352 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
F3P20352 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
F3P20352 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
F3P20352 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
F3P20352 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
F3P20352 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
F3P20352 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
F3P20352 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
F3P20352 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
F3P20352 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
F3P20352 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
F3P20352 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
F3P20352 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
F3P20352 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
F3P20352 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
F3P20352 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
F3P20352 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms