Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P20040 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P20040 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P20040 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P20040 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P20040 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P20040 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P20040 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P20040 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P20040 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P20040 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P20040 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P20040 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P20040 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P20040 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P20040 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P20040 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P20040 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P20040 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P20040 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P20040 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P20040 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P20040 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P20040 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P20040 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P20040 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P20040 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P20040 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P20040 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P20040 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P20040 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P20040 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P20040 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P20040 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P20040 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P20040 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P20040 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P20040 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P20040 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P20040 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P20040 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P20040 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P20040 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P20040 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P20040 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P20040 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P20040 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P20040 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P20040 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P20040 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P20040 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P20040 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P20040 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P20040 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P20040 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P20040 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P20040 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P20040 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
P20040 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P20040 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P20040 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P20040 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P20040 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P20040 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P20040 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P20040 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P20040 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P20040 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
P20040 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P20040 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P20040 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P20040 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P20040 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P20040 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P20040 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P20040 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P20040 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P20040 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P20040 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P20040 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P20040 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P20040 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P20040 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P20040 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P20040 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P20040 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
P20040 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P20040 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P20040 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P20040 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P20040 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P20040 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P20040 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P20040 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P20040 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P20040 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P20040 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P20040 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P20040 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P20040 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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