Protein–RNA interactions for Protein: P19783

Cox4i1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox4i1P19783 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox4i1P19783 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox4i1P19783 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox4i1P19783 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox4i1P19783 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox4i1P19783 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox4i1P19783 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox4i1P19783 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox4i1P19783 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox4i1P19783 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox4i1P19783 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms