Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
P18530 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
P18530 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
P18530 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
P18530 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
P18530 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
P18530 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
P18530 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
P18530 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
P18530 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
P18530 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
P18530 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
P18530 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18530 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18530 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18530 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18530 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18530 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18530 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18530 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18530 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18530 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18530 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18530 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18530 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18530 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18530 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
P18530 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
P18530 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18530 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
P18530 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18530 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18530 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18530 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18530 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18530 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18530 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18530 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18530 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18530 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18530 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
P18530 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18530 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P18530 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18530 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18530 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18530 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18530 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18530 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18530 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18530 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18530 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18530 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
P18530 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
P18530 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18530 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18530 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18530 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18530 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18530 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18530 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18530 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18530 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18530 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18530 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18530 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18530 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18530 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18530 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18530 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18530 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18530 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18530 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18530 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18530 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18530 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18530 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18530 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18530 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
P18530 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18530 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18530 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18530 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18530 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18530 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
P18530 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
P18530 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
P18530 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18530 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18530 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
P18530 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18530 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18530 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18530 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18530 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18530 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18530 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18530 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18530 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
P18530 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms