Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb1P17919 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Hoxb1P17919 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb1P17919 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb1P17919 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb1P17919 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb1P17919 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb1P17919 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb1P17919 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb1P17919 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb1P17919 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb1P17919 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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Hoxb1P17919 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb1P17919 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb1P17919 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb1P17919 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb1P17919 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb1P17919 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb1P17919 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb1P17919 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb1P17919 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb1P17919 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb1P17919 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb1P17919 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb1P17919 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Hoxb1P17919 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb1P17919 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Hoxb1P17919 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb1P17919 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb1P17919 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb1P17919 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb1P17919 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Hoxb1P17919 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxb1P17919 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxb1P17919 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxb1P17919 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Hoxb1P17919 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Hoxb1P17919 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Hoxb1P17919 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxb1P17919 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Hoxb1P17919 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb1P17919 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb1P17919 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb1P17919 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb1P17919 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb1P17919 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb1P17919 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb1P17919 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb1P17919 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb1P17919 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb1P17919 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb1P17919 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb1P17919 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Hoxb1P17919 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb1P17919 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Hoxb1P17919 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb1P17919 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb1P17919 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb1P17919 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Hoxb1P17919 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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