Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms