Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P10404 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P10404 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P10404 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P10404 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P10404 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P10404 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P10404 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P10404 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P10404 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P10404 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P10404 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P10404 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P10404 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P10404 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P10404 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P10404 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P10404 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P10404 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P10404 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P10404 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P10404 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P10404 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P10404 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P10404 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P10404 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P10404 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P10404 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P10404 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P10404 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P10404 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P10404 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P10404 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P10404 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P10404 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P10404 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P10404 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P10404 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P10404 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P10404 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P10404 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P10404 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P10404 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P10404 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P10404 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P10404 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P10404 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P10404 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P10404 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P10404 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P10404 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P10404 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P10404 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P10404 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P10404 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P10404 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P10404 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P10404 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P10404 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P10404 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P10404 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P10404 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P10404 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P10404 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P10404 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P10404 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P10404 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P10404 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P10404 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P10404 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P10404 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P10404 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P10404 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P10404 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P10404 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P10404 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P10404 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P10404 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P10404 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P10404 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P10404 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P10404 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P10404 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P10404 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P10404 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P10404 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P10404 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P10404 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P10404 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P10404 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P10404 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P10404 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P10404 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P10404 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P10404 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P10404 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P10404 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P10404 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P10404 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P10404 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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