Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Becn2P0DM65 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Becn2P0DM65 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Becn2P0DM65 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Becn2P0DM65 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Becn2P0DM65 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Becn2P0DM65 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Becn2P0DM65 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Becn2P0DM65 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Becn2P0DM65 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Becn2P0DM65 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Becn2P0DM65 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Becn2P0DM65 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Becn2P0DM65 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Becn2P0DM65 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Becn2P0DM65 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Becn2P0DM65 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Becn2P0DM65 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Becn2P0DM65 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Becn2P0DM65 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Becn2P0DM65 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Becn2P0DM65 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Becn2P0DM65 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Becn2P0DM65 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Becn2P0DM65 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Becn2P0DM65 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Becn2P0DM65 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Becn2P0DM65 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Becn2P0DM65 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Becn2P0DM65 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Becn2P0DM65 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Becn2P0DM65 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Becn2P0DM65 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Becn2P0DM65 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Becn2P0DM65 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Becn2P0DM65 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Becn2P0DM65 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Becn2P0DM65 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Becn2P0DM65 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Becn2P0DM65 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Becn2P0DM65 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Becn2P0DM65 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Becn2P0DM65 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Becn2P0DM65 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Becn2P0DM65 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Becn2P0DM65 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Becn2P0DM65 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Becn2P0DM65 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Becn2P0DM65 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Becn2P0DM65 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Becn2P0DM65 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Becn2P0DM65 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Becn2P0DM65 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Becn2P0DM65 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Becn2P0DM65 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Becn2P0DM65 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Becn2P0DM65 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Becn2P0DM65 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Becn2P0DM65 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Becn2P0DM65 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Becn2P0DM65 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Becn2P0DM65 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Becn2P0DM65 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Becn2P0DM65 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Becn2P0DM65 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Becn2P0DM65 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Becn2P0DM65 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Becn2P0DM65 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Becn2P0DM65 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Becn2P0DM65 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Becn2P0DM65 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Becn2P0DM65 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Becn2P0DM65 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Becn2P0DM65 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Becn2P0DM65 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Becn2P0DM65 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Becn2P0DM65 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Becn2P0DM65 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Becn2P0DM65 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Becn2P0DM65 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Becn2P0DM65 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Becn2P0DM65 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Becn2P0DM65 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Becn2P0DM65 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Becn2P0DM65 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Becn2P0DM65 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Becn2P0DM65 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Becn2P0DM65 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Becn2P0DM65 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Becn2P0DM65 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Becn2P0DM65 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Becn2P0DM65 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Becn2P0DM65 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Becn2P0DM65 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Becn2P0DM65 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Becn2P0DM65 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Becn2P0DM65 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Becn2P0DM65 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Becn2P0DM65 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Becn2P0DM65 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms