Protein–RNA interactions for Protein: P09084

Pax1, Paired box protein Pax-1, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax1P09084 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pax1P09084 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pax1P09084 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pax1P09084 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pax1P09084 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pax1P09084 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Pax1P09084 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pax1P09084 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pax1P09084 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax1P09084 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax1P09084 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pax1P09084 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pax1P09084 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pax1P09084 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pax1P09084 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pax1P09084 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pax1P09084 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pax1P09084 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pax1P09084 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms