Protein–RNA interactions for Protein: P03888

Mtnd1, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1, mousemouse

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtnd1P03888 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtnd1P03888 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtnd1P03888 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtnd1P03888 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mtnd1P03888 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms