Protein–RNA interactions for Protein: P01910

H2-Aa, H-2 class II histocompatibility antigen, A-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-AaP01910 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms