Protein–RNA interactions for Protein: O89112

Lancl1, LanC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl1O89112 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lancl1O89112 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lancl1O89112 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lancl1O89112 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lancl1O89112 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lancl1O89112 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lancl1O89112 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lancl1O89112 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lancl1O89112 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lancl1O89112 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lancl1O89112 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lancl1O89112 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lancl1O89112 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lancl1O89112 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lancl1O89112 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lancl1O89112 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lancl1O89112 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lancl1O89112 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lancl1O89112 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lancl1O89112 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lancl1O89112 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lancl1O89112 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lancl1O89112 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms