Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MscO88940 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MscO88940 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MscO88940 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MscO88940 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MscO88940 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MscO88940 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MscO88940 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MscO88940 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MscO88940 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MscO88940 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MscO88940 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MscO88940 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MscO88940 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MscO88940 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MscO88940 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MscO88940 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MscO88940 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MscO88940 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MscO88940 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MscO88940 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MscO88940 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MscO88940 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MscO88940 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MscO88940 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MscO88940 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MscO88940 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MscO88940 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MscO88940 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MscO88940 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MscO88940 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MscO88940 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MscO88940 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MscO88940 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MscO88940 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MscO88940 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MscO88940 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MscO88940 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MscO88940 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MscO88940 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MscO88940 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MscO88940 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MscO88940 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MscO88940 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MscO88940 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MscO88940 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MscO88940 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MscO88940 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MscO88940 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MscO88940 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MscO88940 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MscO88940 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MscO88940 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MscO88940 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MscO88940 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MscO88940 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MscO88940 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MscO88940 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MscO88940 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MscO88940 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MscO88940 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MscO88940 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MscO88940 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MscO88940 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MscO88940 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MscO88940 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MscO88940 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MscO88940 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MscO88940 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MscO88940 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MscO88940 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MscO88940 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MscO88940 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MscO88940 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MscO88940 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MscO88940 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MscO88940 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MscO88940 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MscO88940 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MscO88940 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MscO88940 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MscO88940 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MscO88940 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MscO88940 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MscO88940 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MscO88940 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MscO88940 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MscO88940 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MscO88940 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MscO88940 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MscO88940 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MscO88940 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MscO88940 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MscO88940 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MscO88940 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MscO88940 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MscO88940 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MscO88940 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MscO88940 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MscO88940 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MscO88940 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms