Protein–RNA interactions for Protein: O70551

Srpk1, SRSF protein kinase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk1O70551 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srpk1O70551 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srpk1O70551 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srpk1O70551 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srpk1O70551 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srpk1O70551 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srpk1O70551 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srpk1O70551 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srpk1O70551 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srpk1O70551 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srpk1O70551 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srpk1O70551 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srpk1O70551 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srpk1O70551 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srpk1O70551 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srpk1O70551 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srpk1O70551 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srpk1O70551 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srpk1O70551 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms