Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxq1O70220 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxq1O70220 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxq1O70220 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxq1O70220 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxq1O70220 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxq1O70220 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxq1O70220 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxq1O70220 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxq1O70220 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxq1O70220 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxq1O70220 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxq1O70220 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxq1O70220 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxq1O70220 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxq1O70220 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxq1O70220 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxq1O70220 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxq1O70220 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Foxq1O70220 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Foxq1O70220 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Foxq1O70220 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxq1O70220 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms