Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk2a2O54833 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms