Protein–RNA interactions for Protein: O35716

Socs1, Suppressor of cytokine signaling 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Socs1O35716 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Socs1O35716 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Socs1O35716 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Socs1O35716 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Socs1O35716 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Socs1O35716 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Socs1O35716 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Socs1O35716 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Socs1O35716 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Socs1O35716 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms