Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms