Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Casq1O09165 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Casq1O09165 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Casq1O09165 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms