Protein–RNA interactions for Protein: O08532

Cacna2d1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d1O08532 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cacna2d1O08532 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacna2d1O08532 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms