Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm2056J3QQ02 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms