Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccer2J3QPU5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms